Universitas Nusantara Manado telah terakreditasi BAN-PT dan memiliki 5 Fakultas, yaitu:
- Fakultas Bahasa Asing
- Fakultas Ekonomi
- Fakultas Ilmu Komputer
- Fakultas Pertanian
- Fakultas Teknik
Program Studi pada Fakultas yang ada juga telah terakreditasi BAN-PT.
